Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms