Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc146E9Q9F7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc146E9Q9F7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms