Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms