Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms