Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap46E9Q2C0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap46E9Q2C0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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