Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc28a1E9PXX9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a1E9PXX9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms