Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r177E9PXM3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r177E9PXM3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms