Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54bE9PXC0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms