Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc144bE9PVZ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms