Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FgaE9PV24 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms