Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3bE9PUL3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clca3bE9PUL3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms