Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930444G20RikD3Z741 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930444G20RikD3Z741 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms