Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm3543D3Z235 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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