Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem200bD3Z0P8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem200bD3Z0P8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms