Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc8D3YZV8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms