Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms