Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3259D3YUK0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms