Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna7C0LLJ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms