Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzd8B9EJ80 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzd8B9EJ80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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