Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip3B9EHT4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms