Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm20547B8JJN0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm20547B8JJN0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm20547B8JJN0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm20547B8JJN0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm20547B8JJN0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm20547B8JJN0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm20547B8JJN0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20547B8JJN0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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