Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud7bB2RUR8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms