Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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