Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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