Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt4B2RU40 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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