Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apol7aB2RT54 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms