Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Otud4B2RRE7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms