Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ythdc2B2RR83 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ythdc2B2RR83 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms