Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC035947B2RQY6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms