Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brpf3B2KF05 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms