Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp40B1B1D3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms