Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm2012B1B0R1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms