Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CK137956B1AYM9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CK137956B1AYM9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms