Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700011M02RikB1AX35 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700011M02RikB1AX35 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms