Protein–RNA interactions for Protein: B1AV28

Gm14862, Predicted gene 14862, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14862B1AV28 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm14862B1AV28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm14862B1AV28 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms