Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms