Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Odf2A3KGV1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf2A3KGV1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms