Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp8b5A3FIN4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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