Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf39A2RT81 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms