Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a3A2AVZ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a3A2AVZ9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms