Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pramef25A2ASI9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef25A2ASI9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pramef25A2ASI9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms