Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rtf1A2AQ19 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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