Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms