Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ambra1A2AH22 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ambra1A2AH22 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms