Protein–RNA interactions for Protein: A2A8C4

Gm13040, Predicted gene 13040, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13040A2A8C4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm13040A2A8C4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm13040A2A8C4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm13040A2A8C4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm13040A2A8C4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm13040A2A8C4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm13040A2A8C4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm13040A2A8C4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm13040A2A8C4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm13040A2A8C4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms