Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdc27A2A6Q5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdc27A2A6Q5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms