Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm27029A2A4P4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm27029A2A4P4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms