Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrp1bA1Z198 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms