Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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