Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Trav4-2A0A075B638 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trav4-2A0A075B638 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Trav4-2A0A075B638 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trav4-2A0A075B638 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav4-2A0A075B638 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav4-2A0A075B638 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trav4-2A0A075B638 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trav4-2A0A075B638 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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